Les ouvertures se succèdent et le réseau de restaurants spécialisés sur le segment viande, atteint 12 ouvertures. Un an plus tard, l’entreprise se structure en Société Anonyme et ouvre son premier bâtiment « solo » en périphérie d’agglomération selon un concept bien identifié, dans des zones commerciales, de loisirs et/ou des pôles d’affaires. Puis, en 1999 elle se dote de son propre atelier d’affinage et de découpe, « Cavia.r. En 2004, le concept La Boucherie Café voit le jour.
En 2008, le réseau qui compte une cinquantaine de restaurants s’adosse à des partenaires financiers. Naxicap Partners (chef de file), Perspectives et Participations Bred et BNP Paribas Développement entrent au capital de La Boucherie S.A. Principalement détenue par la famille Baudaire et son Président Bertrand Baudaire, Christophe Mauxion (Directeur général du groupe La Boucherie) et Jean-Jacques Labrunie (Directeur général de Cavia.r), la holding Morgalex reste actionnaire majoritaire de La Boucherie S.A. À partir de 2009, La Boucherie renforce son maillage du territoire national. Elle ouvre en janvier 2013 à Albertville, son 100ème restaurant. A ce jour, le réseau compte plus de 2 000 franchisés et collaborateurs et plus de 130 restaurants et vise près de 200 établissements à fin 2018.